Pierrefontaine-les-Varans compte 1 417 habitants en 2013. Dans le département du 25 (Doubs), Pierrefontaine-les-Varans est en zone C. L'accès au logement, et en particulier à l'immobilier neuf à Pierrefontaine-les-Varans, est facilité par le PTZ+. Un couple avec 2 enfants peut obtenir 3 000 € à taux zéro si leurs revenus sont inférieurs à 44 000 €.
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